オーガニック系の歯磨き粉にはフッ素入りのものが殆ど無く、虫歯予防という点からは効果があるとは言い切れません。

歯磨き粉は、あくまでも補助的なものなので、プラーク(細菌の塊)がきちんと落とせているかが重要です。
つまり、ちゃんと磨けているかが一番大切になります。
二次的に虫歯予防効果を期待するなら、フッ素入り歯磨き粉を選択しましょう。